Non si può alterare il comando rsync usato dal Portage per aggiornare il proprio albero, ma si possono definire delle variabili relative al comando rsync:
RSYNC_EXCLUDEFROM punta ad un file contenente la lista dei pacchetti e/o categorie che rsync dovrebbe ignorare durante il processo di aggiornamento
RSYNC_RETRIES definisce quante volte rsync dovrebbe provare a connettersi al mirror definito dalla variabile SYNC prima di rinunciarvi. Il valore predefinito per questa variabile è 3.
RSYNC_TIMEOUT definisce i secondi di inattività di una connessione rsync prima di avere un timeout. Il valore predefinito per questa variabile è 180 ma utenti dialup probabilmente dovrebbero aumentare i secondi a 300 o più.