Quando si parla di pacchetti si intendono spesso titoli software che sono disponibili agli utenti Gentoo attraverso l'albero del Portage. L'albero del Portage è una collezione di file ebuild che contengono tutte le informazioni necessarie al Portage per manutenere il software (installare, ricercare,....). Questi ebuild risiedono di default in /usr/portage.

Ogni qualvolta si chiede al Portage di eseguire alcune azioni riguardanti i titoli software, vengono usati gli ebuild del sistema come base. Diviene, così, importante aggiornare regolarmente gli ebuild del sistema in modo tale che Portage sia a conoscenza del nuovo software, degli aggiornamenti, ecc.