Seguono le informazioni su come dichiarare i flag USE in modo permanente.

Come precedentemente menzionato, tutti i flag USE sono dichiarati attraverso la variabile USE. Per facilitare la ricerca e la scelta dei flag USE, viene fornita una configurazione USE predefinita. Questa configurazione è una collezione di flag USE che dovrebbe essere comunemente usata dagli utenti Gentoo ed è dichiarata nel file /etc/make.profile/make.defaults. Segue la configurazione predefinita:

USE="x86 oss apm arts avi berkdb crypt cups encode foomaticdb gdbm gif gpm
 gtk gtk2 imlib jpeg kde gnome libg++ libwww mad mikmod motif mpeg ncurses
 nls oggvorbis opengl pam pdflib png python qt quicktime readline sdl
 slang spell ssl svga tcpd truetype X xml2 xmms xv zlib"

Come è evidente, questa variabile contiene già una serie di parole chiave. Non alterare il file /etc/make.profile/make.defaults per adattare la variabile USE alle proprie necessità dato che le modifiche a questo file vengono sovrascritte ad ogni aggiornamento del Portage.

Per cambiare la configurazione predefinita, è necessario aggiungere o rimuovere parole chiave dalla variabile USE e può essere fatto globalmente definendo la variabile USE nel file /etc/make.conf. In questa variabile è possibile aggiungere flag USE extra, richiesti o rimuoverne di non richiesti nel qual caso occorre anteporre alla parola chiave il segno meno ("-").

Per esempio, per rimuovere il support per KDE e QT ed aggiungere il supporto per ldap, può essere definita la seguente dichiarazione USE in /etc/make.conf:

USE="-kde -qt ldap"